1998 年，教育形势发生巨大变化，大学大规模扩招，学校没有及时扩大招生规模，教育教学成绩在衡水十一所重点中学中列第七名，办学条件远远落后于兄弟市县，省教育厅督促学校改善办学条件。
1999年，学校创造条件使高一扩至12轨，为进一步完善学校管理 ，实行了全封闭管理，净化了教学环境。是年高考，本科上线351人，其中181名学生考入重点院校，教育教学成绩跃升至地区第四名，刘杏娜、王飞、杨秉勋三名学生考入清华大学，薛川、田福聪、彭淑霞三名学生考入北京大学。 9月，学校第一期改扩建工程开工建设。12月，任命周超亮为教学副校长，周景月为政工副校长。实行年级组管理制度，校长包年级，年级主任具体负责，以骨干教师为中坚力量，形成了强有力的年级组。
2000年，针对学校管理现状，校领导班子着手建章立制，制定了《教学常规》、《考试规定》、《班级工作量化方案》、《班主任工作条例》等一系列规章制度，这些规章制度涉及到学校的每一位教职员工，明确了学校领导、各处室的岗位职责，使教育教学工作迈上了一个新台阶。这一年，学校深入开展学习江泽民《关于教育问题的谈话》的学习讨论，提高了教职工政治思想觉悟，加强了以师德建设为中心的教师队伍建设，创造性的开展德育工作和德育系列活动，促进了教师素质和学生思想道德素质的不断提高。为了全面调动班主任工作的积极性，对《班主任量化方案》进行了修改。为加强学生管理，实行了“学生自治管理制度”。6月，第一期工程交工投入使用，建成了科技馆、图书馆、学生宿舍楼、阶梯教室和教工住宅楼，总建筑面积
2001年，制定了《冀州中学教职工聘任制方案》，推行了聘任制，进行定编、定岗、定职、定责，增强了教职工的岗位责任意识，形成了有利于调动教职工积极性的内部运行机制。教育形势不断发展，全国各大院校不断扩招，学校也继续扩轨，3月，高一达到16轨，有38个教学班（复习班数增加），学生总数超过2700人。由于在校生人数的增多，学生程度也出现参差不齐现象，在这种情况下，学校走访名校，借鉴经验，创造性地提出“无缝隙管理”制度，由校长、主任、班主任、科室人员、学生干部组成管理群体，实行24小时全天候无缝隙管理，杜绝了学生中违规违纪现象的发生。学校本着“一个不放弃”的办学原则，实施了希望生工程和尖子生工程。为充分挖掘希望生的潜力，制定班级联席会制度；举办尖子生讲座，利用周六、日课余时间，由多年任高三课的骨干教师举办尖子生知识讲座，培养他们的创新意识和求异思维。当年高考，本科上线771人，298人考入重点院校，乔晓林考入清华大学，崔朝伟、侯建彬、张欣乔三名学生考入北京大学。是年，冀州中学和东北师大联合开办了“教学论研究方向”和“信息教育”两个研究生进修班，学校140名教师参加了学习。这一年，第三期工程开工，包括学生宿舍楼、学生餐厅、教学楼前的广场改造、安装校园网及装备多媒体教室，总投资1215万元。学校洗衣房、浴室、油印室、医务室也相继向社会承包。
2002年，学校按文教局统一部署，在全体干部教师中开展学习“十六大”精神活动，全校上下形成了扎实工作、开拓创新的良好局面。2002年以来，学校下大力气加强教师队伍建设，一方面打造专家型名师，改变以往只教书不研究的现状，使教师由“教书匠”向“专家型”人才转变；另一方面加大青年教师的培养力度，提出了“师带徒”制度，把骨干教师的个体优势转化为全体教师的群体优势，同时对青年教师加强教育和管理，对他们提目标，压担子，开展“多媒体教学技能比赛”、“青年教师优质课大奖赛”、“青年教师汇报课”，为青年教师提供了锻炼的机会和展示才华的舞台。为了提高学校整体师资水平，学校采用开门办学、兼容并包的思想，走出去，请进来，每年组织教师多次赴外地先进学校取经学习，先后与北京四中、101中学、北大附中、吉林一中、唐山一中等名校建立了固定的联系，多次邀请专家到学校举行讲座。这一年，第一次成功在冀中召开了学生家长座谈会，从这一年开始，每年都召开两次家长座谈会。6月，为提高学生的口语表达能力，聘请美籍女教师菲茨·泽瑞为英语口语教师。同期，高一达到16轨，有45个教学班，学生总数超过3500人，正式教职工208人。8月，高考成绩揭晓，1378名学生参考，本科上线达1198人，比上年增加427人，应届本科上线684人，比上年增加170人，应届本科万人口上线率跃居衡水市第一名，杜巧新考入北京大学。9月，在高三创办了研究性学习实验班（理科），培养了学生自主学习、自主探究的能力。同期，学校第三期工程（学生餐厅除外）竣工并投入使用。
2003年，在学校取得优异成绩的情况下，为了防止个别教师产生自足自满情绪，面对飞速发展的教育形势，学校适时提出“二次创业”的口号，提出“振冀州雄风，创全国名校”的宏伟奋斗目标，号召全体教职员工冷静认识当前形势，深入查找不足，树立忧患意识，抢抓机遇，加快发展。全体教职工敬业爱岗，无私奉献，在社会上声誉大增。是年，学校配合文教局制定的家访月活动，积极开展行风建设活动，加强了与社会各界的交流与沟通。
2003年，140名教师从研究生班结业。同期，招聘10名大学毕业生担任德育指导教师，协同政教处、班主任、任课教师对学生的学习、纪律、卫生、安全诸方面，实施24小时全天候“无缝隙管理”，消除了教育盲区；学校进一步落实了年级组管理制度，实施集体备课与教学案一体化；开展警校共建，建立国防教育基地，实施立体教育，举行“十八岁成人仪式”、“国旗下讲话”等丰富多彩的校园文化活动，营造了健康高雅的育人氛围。
2003年，学校餐厅投入使用。这一年，新校门落成，次年，校门左右改为通透围墙。年内又建成一座单面结构的新教学楼和一座内设卫生间的学生公寓楼，当年投入使用。
3月份，高一达到20轨，有教学班56个，学生超过4300人，正式教职工248人。是年高考，重点上线448人，比上年增加了204人，本科二批以上上线987人，比上年增加352人，应届本科二批以上上线人数、万人口上线率居衡水市第一；本科三批以上上线1516人，比上年增加318人，上线率达96.93% ，居衡水市第一；应届本科三批上线人数及万人口上线率均居衡水市第一。理科第一个研究性学习实验班取得优异成绩，张觉德、丁谦学分别列衡水市应届第四名、第五名，被清华大学录取，赵春燕被北京大学录取；文科韩华宁列衡水市应届第九名。随即在各年级创办了研究性学习实验班（理科），成立了音、体、美特长生班。
2004年，任命校长助理李志增为财务副校长，教务主任王启新、教科主任马孟祥为校长助理同时兼任原职务，主抓教学与科研。这一年，进一步加强了教学研究，安排星期三下午学生自主学习，全体教师进行全校性的研讨学习活动，增强了教师的科研意识；深化“调动学生积极性，促进学生发展自主性”课题研究，走“课题研究，带动课堂改革”的路子，加快了全体教师课堂改革的步伐。经过深入研究，学校承担的省级重点课题“现代教育技术在农村高中教学中的应用与研究”和“多媒体网络环境基础下学科教学与学生能力培养的研究”取得阶段性成果。
2004年，在借鉴理科实验班成功经验的基础上，成立了一个文科研究性学习实验班；大胆选拔年轻骨干教师担任年级学科教研组长；加强了课堂练习的针对性，强化了限时训练；实施分层次教学，高三数学、理综合试卷进行了分层次评讲；落实自习不讲课，下自习收作业制度，减轻了学生课业负担。实施新老班主任“结对子”的办法，发挥老班主任“传、帮、带”的作用，促进了班主任队伍的整体发展；
2004年，学校强化各项管理措施，在抓落实上下了功夫，进一步浓化了校园文化氛围，在此基础上不断整理多年来的学校文化积淀，总结学校富有特色的理念和措施，并积极走访全国名校，通过学习，查找不足，积极筹备，创造条件达到全国示范性高中的评估标准。
2004年暑假，为了方便了师生生活，学校对外招标承包了两个小卖部；进行了校园环境建设，建起了读书园一个；为缓解学生住房和饮水问题，建成平房50间，购置饮水锅炉2台；建成了占地33亩的操场，铺设了
近几年来，学校实现了跨越式发展，办学条件达到省内一流水平，教育教学成绩连年攀升。希望生工程与尖子生工程卓见成效，1999年高考，本科上线率46.61%，2000年71.43%，2001年78.2%，2002年85.05%，2003年96.93%，2004年99.61%，2007年高考，本一上线1006人，本科上线率99.56%，2008年高考，本一上线1340人，本二上线2539人，本科上线率99.6%，实现了大面积丰收的目标；尖子生的培养成绩斐然，从1998年至今，先后有60余名学生考入清华、北大。蓬勃发展的冀州市中学正向全国示范性普通高中迈进。
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